將績效管理作為加強現(xiàn)代預算管理制度和現(xiàn)代財政制度建設、推動國家治理體系和治理能力現(xiàn)代化的一項重要舉措，具有重大的現(xiàn)實意義，但具體到實施預算績效管理還有很多理論和實踐問題需要深入思考、研究和探索，尤其是在實施過程中需要明確地原則問題。

實施預算績效管理的指標體系包括目標指標體系和績效評價指標體系兩個方面，而績效評價指標體系是為目標指標體系的實現(xiàn)服務的。

因此，政府與事業(yè)單位指標體系的設計必須圍繞政策的貫徹落實、職能職責有效履行、公共財政資源優(yōu)化配置效率來進行。

一是準確把握指標體系設計的依據(jù)。目標體系的設計站位要高，要把黨和國家的方針政策、發(fā)展戰(zhàn)略、法律法規(guī)和制度作為目標體系和評價指標體系設計的基本遵循，把部門預算、項目預算的確定和考核與國家整體發(fā)展戰(zhàn)略確定的目標任務有機結(jié)合起來。

二是立足財政改革發(fā)展和部門履職的實際。一定時期的預算安排總體水平和結(jié)構(gòu)既反映政府及其職能部門的活動，也受制于經(jīng)濟體制和財政預算管理體制，因此，預算績效的目標指標體系和評價指標體系的設計既要立足于政府及其職能部門履職的實際，也要立足經(jīng)濟社會發(fā)展和財政改革發(fā)展的實際與趨勢，還要與財政中長期發(fā)展規(guī)劃和年度計劃、項目規(guī)劃等緊密關(guān)聯(lián)，做好基于全面預算的戰(zhàn)略體系規(guī)劃。

三是堅持問題導向。我國實施預算績效管理時間不長，目前還存在預算績效指標不完整不細化、量化程度不夠、可衡量性不夠、與項目匹配度不高、指標設置不規(guī)范等問題，需要在實踐探索中不斷進行績效管理體系優(yōu)化。

四是簡明、可操作。實施預算績效管理是一個系統(tǒng)工程，涉及方方面面，而且要接受社會各方面監(jiān)督。指標體系的設計要做到盡可能的精煉、明晰，便于實際操作和接受各方面的監(jiān)督，要盡量避免繁雜，而加強實際操作性。另外，目前的評價，特別是自評價形成的結(jié)果可信度、可用度尚存在差距，需要進一步優(yōu)化簡練指標體系。